هیات رئیسه سنی وظیفه اداره انجام مراسم تحلیف، قرعهکشی برای تعیین اعضای شعب، توزیع اعتبارنامهها بین شعب، برگزاری انتخابات هیأت رئیسه و تمشیت امور اداری مجلس تا زمان انتخاب هیأت رئیسه را به عهده دارد. رئیس سنی مجلس دوازدهم علاءالدین بروجردی و نایب رئیس سنی، حسینعلی شهریاری است.
سید علی خامنهای، در مصاحبهای با روزنامه جمهوری اسلامی در تاریخ ۲ آبان ۱۳۶۰، از تصمیم شجاعانه مجلس در عدم رأی اعتماد به نخستوزیری دکتر ولایتی تمجید کرد و استقلال مجلس را مورد تأکید قرار داد.